يعود إصدار المخطوطات الرقمية إلى رسالة المكتبة لاستخدام التقنيات الرقمية الحديثة. ويهدف مشروع مكتبة المخطوطات الرقمية إلى نشر ثروة مخطوطات التراث العربي في صورة رقمية. وقد شهد عام ٢٠٠٧ إصدار المجموعة الخامسة والسادسة من مكتبة المخطوطات الرقمية، وتحديدًا دير سانت كاترين ومجموعة مكتبة السويد القومية. وتتكون كل مجموعة من سبع مخطوطات نادرة وكتيب تقديمي.
تضم دار الكتب والوثائق القومية المصرية ثروة قومية هائلة وفريدة من الخرائط التاريخية والبرديات العربية. انتهى مركز توثيق التراث الحضاري والطبيعي (CULTNAT) بالتعاون مع دار الكتب والوثائق القومية من رقمنة مجموعتين أرشيفيتين من نحو عشرة آلاف خريطة وثلاثة آلاف وخمسمائة بردية. وقد سهل إنشاء قاعدة بيانات تحتوي على المجموعات المرقمنة مهمة دار الكتب والوثائق القومية لخدمة زوارها من الباحثين والأكاديميين. ويجري الآن طبع كتاب عن مجموعة الخرائط بعنوان "مصر في تاريخ الخرائط" باللغتين العربية والإنجليزية (١٥٩٥-١٨٤٠ تقريبًا) مصحوبًا بأسطوانة مدمجة.
تعد مجلة الهلال أقدم مجلة ثقافية في العالم العربي، والمجلة الوحيدة التي تصدر بصفة منتظمة منذ أكثر من مائة سنة. ومنذ عددها الأول في ١٨٩٢، تركت مجلة الهلال أثرها في تاريخ العالم العربي بصفة عامة وتاريخ مصر بصفة خاصة، كما لعبت دورًا رائدًا في تحديث الفكر العربي والتعاون من أجل التطور الثقافي.وتعكس المجلة الفكر العربي خلال القرن الماضي، مما يجعلها أداة قيمة بالنسبة للباحثين والمؤرخين وكذلك العامة. ولهذا السبب، اتخذت مكتبة الإسكندرية مبادرة ترقيم المجموعة كلها المكونة من مائة وأربعة عشر عددًا وتجميعها على اثنتي عشرة أسطوانة DVD مزودة بأدوات التصفح وإمكانيات البحث الضرورية في واجهة سهلة الاستخدام. تباع الأسطوانات في منفذ بيع الكتب بمكتبة الإسكندرية.
يسعى هذا المشروع الطموح إلى الحصول على أكبر عدد ممكن من النسخ الرقمية والميكروفيلم لمجموعات المخطوطات حول العالم، وذلك لتوفير مصادر البحث العلمي ودعم التعاون الأكاديمي ونشر التراث العلمي، وخصوصًا الأعمال المتعلقة بتاريخ العلوم وإسهامات الحضارة العربية الإسلامية للإنسانية. ويهدف المشروع الذي انطلق عام ٢٠٠٥ إلى الوصول إلى مائة ألف مخطوط. وقد تبادل مركز المخطوطات نسخًا من مخطوطات عربية مع معهد المخطوطات العربية بالقاهرة ومركز الجمعة المجيد للتراث والثقافة بالإمارات والمكتبة المركزية للمخطوطات الإسلامية في وزارة الأوقاف المصرية؛ مما أضاف خمسة آلاف ومائتين وثمانية وتسعين مخطوطًا لمجموعة المركز، محققًا أربعين في المائة من هدفه. وجميع المخطوطات متاحة للجمهور في قاعات اطلاع خاصة استضافت ألفًا وتسعمائة وخمسة وعشرين باحثًا من مختلف أنحاء العالم خلال عام واحد.